近日,中國科學院大連化學物理研究所研究員李國輝團隊與中科院上海生物化學與細胞生物學研究所研究員楊巍維團隊合作,通過分子動力學模擬的手段,解釋了膠質瘤細胞中關鍵氨基酸的磷酸化過程對腫瘤細胞生長的影響,相關結果以共同通訊作者的形式發表于《分子細胞》(Molecular Cell)雜志。
大連化物所生物分子模擬應用研究取得新進展
楊巍維團隊發現了磷酸甘油酸激酶(PGK1)的氨基酸T243磷酸化后可改變PGK1和底物的親和力,從而促進PGK1糖酵解方向的活性,以及促進膠質瘤細胞的有氧糖酵解、細胞增殖和腫瘤生長。但是,僅依據實驗無法在分子層面上,詳細闡明T243磷酸化過程是如何影響PGK1與底物結合的分子機制。
為了回答這一關鍵科學問題,李國輝團隊與楊巍維團隊密切合作,運用分子動力學模擬的方法,針對T243磷酸化前后PGK1與底物結合的分子機制進行研究,并發現T243的磷酸化影響了另一關鍵氨基酸(K216)的側鏈朝向,進而對PGK1和底物結合的關鍵相互作用產生影響,導致磷酸化前后底物與PGK1親和力發生明顯變化。這一發現,從分子層面對實驗結果進行了驗證,并為膠質瘤治療的新策略提供了詳細的理論依據。
該研究工作得到國家自然科學基金、國家杰出青年科學基金的資助。