根據ARP項目二期網絡安全加固實施方案，海洋所改進了入侵監測IDS的部署模式，與ARP中心節點實現了多級信息監控，除在本所節點可以監控到異常數據外，ARP中心節點也可以集中監控arp系統中的網絡和服務器運行情況，及時發現威脅系統安全的行為，并發出告警信息，協助分節點進行處理，保障系統的安全穩定運行。同時，升級了安全準入VPN系統，增強了安全性和兼容性。

ARP項目一期中，各所已經實現了數據本地備份，這種備份方式可以保證應用系統主機故障時可以通過本地的備份進行恢復。但如果發生火災、地震等自然災害，本地備份的數據也同樣會遭受破壞，同樣會對系統造成災難性后果。根據ARP項目二期地區數據分中心的建設方案，ARP數據要實現本地、同城異地、院統一存儲中心三級備份機制，海洋所由于沒有同城備份條件，直接實現了將備份數據存儲在院統一存儲中心，目前的備份策略為每日增量備份，每周全備份。