8月23-25日,為深入做好中國科學院超級計算環境建設,提高超級計算分中心運維服務和計算應用水平,中科院超級計算環境總中心專業培訓團隊到中國科學院海洋研究所開展青島分中心高性能計算培訓服務,中科院海洋研究所、中科院青島生物能源與過程研究所、國家海洋局第一海洋研究所、中國海洋大學等70多位研究人員和學生參加了培訓。
此次培訓為期三天,培訓課程包括計算集群系統管理、MPI并行編程、科學計算網格環境使用、OpenMP并行編程、科學計算可視化基礎等,針對青島分中心超級計算應用特點及用戶需求,通過理論與實踐相結合的課程設置,提高學員對超級計算系統環境的理解和掌握,幫助其更好地利用中科院超級計算環境的強大資源,促進超級計算應用水平的提高。培訓期間,培訓團隊人員還參觀了青島分中心機房,就分中心集群管理、用戶管理、程序并行等問題進行了深入交流。
中國科學院高性能計算環境青島分中心暨中國科學院海洋研究所高性能計算中心(以下簡稱青島分中心)是中國科學院高性能計算環境三層計算網格的中間層,青島分中心高性能計算環境采用集群結構,擁有72個計算節點,1152個計算核心,每核心配置3GB以上內存,峰值計算能力10萬億次/秒;擁有100TB存儲能力。集群72個計算節點通過20Gb Infiniband網絡互聯;使用8個IO節點連接SAN存儲;同時使用千兆以太網作為管理網絡。計算網格節點部署也同時完成,成為科學院高性能計算網格的一部分。
青島分中心部署的系統軟件資源包括:Suse Linux 10操作系統,Lustre并行文件系統,Intel和PGI編譯器;集群作業調度系統采用Platform公司的LSF;集群監控系統采用曙光公司的Gridview,集群電力控制軟件使用曙光公司的Powerconf。青島分中心目前部署了有關物理海洋學和生物信息學方面應用模式和軟件,主要應用領域涉及物理海洋、生物信息、地球物理、資源環境等方面,主要服務于海洋科學研究、生物能源與過程研究對高性能計算的需求。同時,青島分中心將面向社會開放,重點支持科學研究領域,兼顧政府、企業高技術應用領域及其他行業對高性能計算的需求。目前已與青島市高新技術開發區簽署共建協議,推進大型儀器設備的共享共用。
2009年11月份國家發布中國高性能計算機性能TOP100排行榜,青島分中心名列第73位。青島分中心積極聯合各方推進青島地區高性能計算的應用,著力培養一支高性能計算應用服務與技術支持隊伍,同時在研發具有自主知識產權的高性能計算模式和并行計算軟件方面開展工作,努力為地方科研、教育和經濟社會的發展做出貢獻。