5月25日,國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)在線報道了中科院海洋所許飛副研究員與英國等科學家的合作研究成果。該研究以長牡蠣為對象,采用生物信息學和分子生物學技術證明了長牡蠣中存在Pdx-insulin調控通路,表明關鍵轉錄因子Pdx調控胰島素基因表達的功能可以追溯到兩側對稱動物的共同祖先。
今年是胰島素發現100周年,作為研究最深入的生物大分子之一,關于其起源和演化歷史還有很多問題沒有解決。胰島素純化工作的主要參與者James Collip在胰島素發現之初就開始關注其在不同動物中的存在情況,并于1923年在雙殼貝類砂海螂(Mya arenaria)中鑒定到類似胰島素活性的物質存在。然而越來越多的研究表明,無脊椎動物和脊椎動物類胰島素基因無論在結構還是表達模式方面均存在很大差異。尤其是線蟲、果蠅等模式無脊椎動物的基因組特化嚴重,丟失了Pdx等人類胰島素基因的關鍵轉錄因子。動物類胰島素基因復雜的演化歷史還需要進一步闡明。
隨著基因組信息的不斷積累,科學家意識到海洋冠輪動物可能具有更加原始和普遍的基因組成。許飛副研究員長期以來聚焦在貝類激素調控系統,研究海洋無脊椎動物基因調控網絡的演化歷史。本研究系統分析了長牡蠣類胰島素基因家族成員的結構、表達及其進化特征,發現牡蠣類胰島素基因多樣性豐富,在兩側對稱動物的主要類胰島素成員中具有廣泛代表性。研究進一步通過轉錄組技術探討了動物腸道系統的同源性,發現貝類和脊椎動物中腸系統具有較大的功能相似性,貝類“肝胰腺”和脊椎動物復雜的腸道系統各自獨立進化,但是可能都源于表達Pdx基因的內胚層區域。通過靶向開放染色質技術鑒定到cgILP基因的轉錄調控區,并鑒定到cgPdx基因的結合基序。通過雙熒光報告基因實驗和染色質免疫共沉淀等技術證明了牡蠣Pdx和NeuroD的協同作用可以調控牡蠣cgILP的表達。
長牡蠣類胰島素基因系統進化分析
長牡蠣類胰島素基因表達模式分析
長牡蠣cgILP基因轉錄調控區基序解析
許飛副研究員為論文第一和通訊作者。上述研究得到了國家自然科學基金項目、中國科學院海洋大科學中心重點部署項目和國家留學基金的共同資助。
論文題目為:Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals
原文鏈接如下:https://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-23216-7
Fei Xu, Ferdinand Marl taz, Daria Gavriouchkina, Xiao Liu, Tatjana Sauka-Spengler, Guofan Zhang, Peter WH Holland. Evidence from oyster suggests an ancient role for Pdx in regulating insulin gene expression in animals. Nature Communications.