近日,中國科學院大連化學物理研究所分子模擬與設計研究組研究員李國輝團隊受邀以綜述形式,系統介紹了冷凍電鏡技術和多尺度分子模擬相結合在生物大分子復合體結構和功能調控關系上的突破和方向。
結合冷凍電鏡技術和多尺度模擬分析大型生物復合體動態組裝和調控機制
李國輝團隊長期致力于理論與計算生物學方法發展與應用等方面的研究,近年來在生物大分子動力學功能機理之間關系的理論計算研究方面取得了豐碩成果,先后在Nature、Science、Cell及其子刊發表11篇研究論文,引起了國內外的廣泛關注。
該綜述在生物大分子復合體研究的復雜性和挑戰性背景下,回顧了近兩年利用多尺度分子模擬和日趨成熟的單細胞冷凍電鏡技術相結合的方法,在蛋白質-RNA/DNA復合體、蛋白質-蛋白質復合體、膜蛋白復合體等復雜生物體系多蛋白組裝動態調控機制的相關研究。綜述重點闡述了結合分子模擬和單細胞冷凍電鏡方法自身特點和優勢在復雜大分子生物體系時間和空間尺度的不斷突破的觀點,并提出了未來的挑戰與發展趨勢,研究廣泛涉及到生物化學、分子生物學、細胞生物學、生物物理學、計算生物學、化學等領域。
該綜述文章以“Multiscale Simulations of Large Complexes in Conjunction with Cryo-EM Analysis”為題發表在Current Opinion in Structural Biology期刊的Theory and Simulation/Computational Methods欄目中。該工作的第一作者是大連化物所副研究員廖晨伊和助理研究員劉野。相關工作得到國家自然科學基金、中科院B類先導專項“生物大分子復合體結構與功能的跨尺度研究”等項目的支持。